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为了完成世界第一高难度手术Batista的论文，明真大学的加藤晶（稲森いずみ饰）找到了曾领导过“医龙”（即世界最高水平救命医疗队）的朝田龍太郎（坂口憲二饰）帮忙。虽然在技术上是超一流的天才外科医生，朝田却因过于强烈的自我风格而遭到某些人的厌恶，最后所有的医院都将其拒之门外。
来到明真后，朝田开始着手组建一支team完成手术，但他发现这里的医生似乎都是些碌碌之辈，不关心病人的死活，任何决策都以降低医院死亡率为出发点，就连直属上司野口教授（岸部一徳饰）也仅仅是将病人当作辅助自己登上院长之位的棋子。还由于对参与Batista这样高难度的手术所要承担的风险及手术成功带来的利益，每个人都心知肚明，惊涛骇浪般的明争暗斗一触即发。